خمارلو ( Khomarlu) یکی از شهرهای استان آذربایجان شرقی ایران است. این شهر مرکز شهرستان خداآفرین می‌باشد. طبق نوشته لغتنامه دهخدا، در گذشته‌ای نه چندان دور، خمارلو روستایی بود با ۳۹۶ تن سکنه. در آستانه انقلاب سفید، که نقشی عمده در فروپاشی نهایی ساختار ایلی ایران داشت، تیره ای از ایل محمد خانلو، شامل ۶۰ خانوار، از روستای خمارلو بعنوان قشلاق استفاده میکردند. اهمیت داه صرفاً به خاطر داشتن شعبه اداره مرزبانی بود. بر اساس سرشماری سال ۲۰۰۶، جمعیت شهر ۱۲۲۲ نفر در ۳۳۴ خانوار است. این رشد بالای جمعیتی در حالی اتفاق افتاده بود که جمعیّت روستاهای ناحیه، خصوصاً روستاهای مناطق کوهستانی تر، به شدت پایین آمده بود (برای مثال موردعباس‌آباد را ملاحظه کنید). به علت مرکزیت شهرستان انتظار می‌رود رشد جمعیت بالا در سالهای آتی همچنان حفظ شود. البته، ساکنین جدید عموماً کسانی هستند که از مناطق خارج شهرستان برای کار در ادارات تازه تاسیس می‌آیند.

یکی از آثار قدیمی و مهم شهرستان خداآفرین پل های قدیمی و تاریخی خداآفرین در نزدیکی شهرخمارلوقرار دارند. یکی از دو پل خراب شده ولی دیگری تعمیر شده است و هنوز هم برای پیاده قابل استفاده است . طول پل سالم ۱۶۰متر است که ۱۲۰ متر متعلق به ایران و ۴۰ متر متعلق به جمهوری آذربایجان است . محل پل ها تنگ ترین معابر رود ارس می باشد که بستر سنگی دارد ولی سایر جاهای محل عبور رود آهکی و نرم است که در قدیم برای ساختن پل توانایی و امکانات نداشتند .

پروژه‌ای که در گسترش خمارلو تاثیر مهمی داشت سد خدا آفرین بود که اخیراً آبگیری شده است.